Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc10Q3TLI0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc10Q3TLI0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms