Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 YDR537CYDR537C 606 nt3.07□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YER135CYER135C 393 nt3.07□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 RPL15AYLR029C 615 nt3.07□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 FLO9YAL063C 3969 nt3.07□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 POL2YNL262W 6669 nt3.07□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 BRE5YNR051C 1548 nt3.07□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 STP2YHR006W 1626 nt3.07□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 SHS1YDL225W 1656 nt3.07□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 MUS81YDR386W 1899 nt3.07□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 EMI1YDR512C 564 nt3.06□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.06□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 RPA12YJR063W 378 nt3.06□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YAR070CYAR070C 300 nt3.06□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YNL146WYNL146W 303 nt3.06□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YOL114CYOL114C 609 nt3.06□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 MBA1YBR185C 837 nt3.06□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 EXO84YBR102C 2262 nt3.05□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 DUF1YOL087C 3351 nt3.05□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 TCP1YDR212W 1680 nt3.05□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 RTT105YER104W 627 nt3.05□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 MIC19YFR011C 513 nt3.05□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 RPS21BYJL136C 264 nt3.05□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.05□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt3.05□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YLR076CYLR076C 423 nt3.05□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YML108WYML108W 318 nt3.05□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt3.05□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt3.05□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YPL034WYPL034W 498 nt3.05□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 RRI2YOL117W 1938 nt3.05□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 SRP68YPL243W 1800 nt3.05□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 STI1YOR027W 1770 nt3.05□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 HBT1YDL223C 3141 nt3.04□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 MAK21YDR060W 3078 nt3.04□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 NTO1YPR031W 2247 nt3.04□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 PPN1YDR452W 2025 nt3.04□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 SNA4YDL123W 423 nt3.04□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 PAU10YDR542W 363 nt3.04□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YER068C-AYER068C-A 432 nt3.04□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 PAU11YGL261C 363 nt3.04□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 RPL11BYGR085C 525 nt3.04□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 MVB12YGR206W 306 nt3.04□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt3.04□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 RNP1YLL046C 750 nt3.04□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 PAU4YLR461W 363 nt3.04□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YOR105WYOR105W 327 nt3.04□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 RPL11AYPR102C 525 nt3.04□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 PFK26YIL107C 2484 nt3.04□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 FUN30YAL019W 3396 nt3.03□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 CHS2YBR038W 2892 nt3.03□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 EAP1YKL204W 1899 nt3.03□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 RIX1YHR197W 2292 nt3.03□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 BNI4YNL233W 2679 nt3.03□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.03□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YDR090CYDR090C 933 nt3.03□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 CRG1YHR209W 876 nt3.03□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 BET3YKR068C 582 nt3.03□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 RIO2YNL207W 1278 nt3.03□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 LTP1YPR073C 486 nt3.03□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YBR285WYBR285W 435 nt3.03□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 MAK5YBR142W 2322 nt3.03□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YMR018WYMR018W 1545 nt3.03□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 UTP15YMR093W 1542 nt3.03□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 DIA2YOR080W 2199 nt3.02□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 CHO2YGR157W 2610 nt3.02□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 IRC2YDR112W 309 nt3.02□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YGR017WYGR017W 894 nt3.02□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YHR212CYHR212C 336 nt3.02□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 SPC1YJR010C-A 285 nt3.02□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YAR060CYAR060C 336 nt3.02□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YLR287CYLR287C 1068 nt3.02□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 MPD2YOL088C 834 nt3.02□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YOR053WYOR053W 342 nt3.02□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YPL185WYPL185W 396 nt3.02□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt3.02□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 snR54snR54 86 nt3.02□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 FAA2YER015W 2235 nt3.02□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 SYO1YDL063C 1863 nt3.02□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 TIF4631YGR162W 2859 nt3.02□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YJL132WYJL132W 2253 nt3.02□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 NMD2YHR077C 3270 nt3.01□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 VAC14YLR386W 2643 nt3.01□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 VAS1YGR094W 3315 nt3.01□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 RPB9YGL070C 369 nt3.01□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 USE1YGL098W 738 nt3.01□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YJL086CYJL086C 369 nt3.01□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt3.01□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 RIM9YMR063W 720 nt3.01□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.01□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 DAS1YJL149W 1992 nt3.01□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YAK1YJL141C 2424 nt3.01□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YSP2YDR326C 4317 nt3.01□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 DBF20YPR111W 1695 nt3.01□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 GDI1YER136W 1356 nt3□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 SPO14YKR031C 5052 nt3□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YAT2YER024W 2772 nt3□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 FMN1YDR236C 657 nt3□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YER006C-AYER006C-A 318 nt3□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YGL015CYGL015C 393 nt3□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 ERV1YGR029W 570 nt3□□□□□ -1.93
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