Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm2aP59997 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm2aP59997 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm2aP59997 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm2aP59997 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm2aP59997 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm2aP59997 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm2aP59997 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm2aP59997 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm2aP59997 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm2aP59997 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm2aP59997 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm2aP59997 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm2aP59997 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm2aP59997 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm2aP59997 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm2aP59997 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm2aP59997 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm2aP59997 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm2aP59997 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm2aP59997 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm2aP59997 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm2aP59997 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm2aP59997 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm2aP59997 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Kdm2aP59997 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm2aP59997 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm2aP59997 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm2aP59997 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm2aP59997 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm2aP59997 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms