Protein–RNA interactions for Protein: P35736

YKL050C, Uncharacterized protein YKL050C, yeast

Predictions only

Length 922 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL050C	P35736	SHS1	YDL225W	1656 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YKL050C	P35736	DBF20	YPR111W	1695 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YKL050C	P35736	YCR108C	YCR108C	192 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YKL050C	P35736	DYN2	YDR424C	279 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YKL050C	P35736	RSR1	YGR152C	819 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YKL050C	P35736	RPL6A	YML073C	531 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YKL050C	P35736	UBX4	YMR067C	1251 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YKL050C	P35736	RPS16A	YMR143W	432 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YKL050C	P35736	NTC20	YBR188C	423 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YKL050C	P35736	YJL132W	YJL132W	2253 nt		3.09	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	YDR179W-A	YDR179W-A	1392 nt		3.09	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	MET6	YER091C	2304 nt		3.09	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	AFR1	YDR085C	1863 nt		3.09	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	SWC4	YGR002C	1431 nt		3.09	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	TAO3	YIL129C	7131 nt		3.09	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	TSC11	YER093C	4293 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	YOR296W	YOR296W	3870 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	VAC8	YEL013W	1737 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	snR59	snR59	78 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	AST2	YER101C	1293 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	YLR230W	YLR230W	306 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	YMR181C	YMR181C	465 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	YNL150W	YNL150W	408 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	YME2	YMR302C	2553 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	ILS1	YBL076C	3219 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	BUD4	YJR092W	4344 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	ATG13	YPR185W	2217 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	RPN3	YER021W	1572 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	BIT61	YJL058C	1632 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	NDT80	YHR124W	1884 nt		3.07	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	YIL169C	YIL169C	2988 nt		3.07	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	YPP1	YGR198W	2454 nt		3.07	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	YIL029C	YIL029C	429 nt		3.07	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	SYS1	YJL004C	612 nt		3.07	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	PHD1	YKL043W	1101 nt		3.07	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	RIM9	YMR063W	720 nt		3.07	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	RPL23A	YBL087C	414 nt		3.07	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	HSP10	YOR020C	321 nt		3.07	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	YOR385W	YOR385W	873 nt		3.07	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	RRG8	YPR116W	834 nt		3.07	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	GAL80	YML051W	1308 nt		3.07	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	UTP15	YMR093W	1542 nt		3.07	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	RSE1	YML049C	4086 nt		3.07	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	MRH1	YDR033W	963 nt		3.06	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	TIM11	YDR322C-A	291 nt		3.06	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	YIL068W-A	YIL068W-A	384 nt		3.06	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	YLR012C	YLR012C	300 nt		3.06	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	YLR222C-A	YLR222C-A	231 nt		3.06	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	YLR224W	YLR224W	1110 nt		3.06	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	YLR257W	YLR257W	966 nt		3.06	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	RPS12	YOR369C	432 nt		3.06	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	YBR062C	YBR062C	543 nt		3.06	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	YPR050C	YPR050C	414 nt		3.06	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	CWC22	YGR278W	1734 nt		3.05	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	CDC55	YGL190C	1581 nt		3.05	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	UTP14	YML093W	2700 nt		3.05	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	RRT13	YER066W	558 nt		3.05	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	YER091C-A	YER091C-A	222 nt		3.05	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	CSE4	YKL049C	690 nt		3.05	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	CWC24	YLR323C	780 nt		3.05	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	SMA2	YML066C	1110 nt		3.05	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	RPL16B	YNL069C	597 nt		3.05	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	PET123	YOR158W	957 nt		3.05	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	MRPL40	YPL173W	894 nt		3.05	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	ARK1	YNL020C	1917 nt		3.05	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	CEP3	YMR168C	1827 nt		3.05	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	SHE4	YOR035C	2370 nt		3.04	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	HMF1	YER057C	390 nt		3.04	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	RPL23B	YER117W	414 nt		3.04	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	YJL086C	YJL086C	369 nt		3.04	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	COA4	YLR218C	453 nt		3.04	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	PDP3	YLR455W	915 nt		3.04	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	AIM36	YMR157C	768 nt		3.04	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	RUF22	RUF22	515 nt		3.04	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	NGL1	YOL042W	1092 nt		3.04	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	TFC4	YGR047C	3078 nt		3.04	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	GEA1	YJR031C	4227 nt		3.04	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	DYN1	YKR054C	12279 nt		3.03	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	JJJ2	YJL162C	1752 nt		3.03	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	YGR053C	YGR053C	852 nt		3.03	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	CIC1	YHR052W	1131 nt		3.03	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	RPF1	YHR088W	888 nt		3.03	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	YLR379W	YLR379W	375 nt		3.03	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	RRD2	YPL152W	1077 nt		3.03	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	PIS1	YPR113W	663 nt		3.03	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	PHR1	YOR386W	1698 nt		3.03	□□□□□ -1.92
YKL050C	P35736	MAL33	YBR297W	1407 nt		3.02	□□□□□ -1.93
YKL050C	P35736	SCY1	YGL083W	2415 nt		3.02	□□□□□ -1.93
YKL050C	P35736	YOR343W-A	YOR343W-A	1317 nt		3.02	□□□□□ -1.93
YKL050C	P35736	MSB2	YGR014W	3921 nt		3.02	□□□□□ -1.93
YKL050C	P35736	YEL030C-A	YEL030C-A	315 nt		3.02	□□□□□ -1.93
YKL050C	P35736	PRM8	YGL053W	714 nt		3.02	□□□□□ -1.93
YKL050C	P35736	ERV1	YGR029W	570 nt		3.02	□□□□□ -1.93
YKL050C	P35736	RPL8B	YLL045C	771 nt		3.02	□□□□□ -1.93
YKL050C	P35736	MRPL44	YMR225C	297 nt		3.02	□□□□□ -1.93
YKL050C	P35736	YNL122C	YNL122C	348 nt		3.02	□□□□□ -1.93
YKL050C	P35736	SRC1	YML034W	2505 nt		3.02	□□□□□ -1.93
YKL050C	P35736	ECM21	YBL101C	3354 nt		3.02	□□□□□ -1.93
YKL050C	P35736	MMS1	YPR164W	4224 nt		3.01	□□□□□ -1.93
YKL050C	P35736	TMA64	YDR117C	1698 nt		3.01	□□□□□ -1.93

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.4 ms