Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRAP19793 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRAP19793 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRAP19793 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRAP19793 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRAP19793 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRAP19793 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRAP19793 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRAP19793 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRAP19793 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRAP19793 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRAP19793 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRAP19793 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRAP19793 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRAP19793 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRAP19793 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRAP19793 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRAP19793 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRAP19793 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRAP19793 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRAP19793 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRAP19793 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRAP19793 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRAP19793 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RXRAP19793 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RXRAP19793 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RXRAP19793 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RXRAP19793 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RXRAP19793 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RXRAP19793 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RXRAP19793 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RXRAP19793 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RXRAP19793 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RXRAP19793 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RXRAP19793 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RXRAP19793 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RXRAP19793 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RXRAP19793 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RXRAP19793 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RXRAP19793 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RXRAP19793 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RXRAP19793 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RXRAP19793 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RXRAP19793 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RXRAP19793 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RXRAP19793 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RXRAP19793 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RXRAP19793 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRAP19793 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RXRAP19793 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RXRAP19793 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RXRAP19793 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RXRAP19793 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RXRAP19793 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RXRAP19793 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RXRAP19793 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RXRAP19793 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RXRAP19793 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RXRAP19793 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RXRAP19793 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RXRAP19793 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RXRAP19793 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RXRAP19793 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RXRAP19793 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RXRAP19793 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RXRAP19793 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RXRAP19793 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RXRAP19793 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RXRAP19793 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RXRAP19793 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RXRAP19793 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RXRAP19793 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms