Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhoP15409 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RhoP15409 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhoP15409 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhoP15409 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhoP15409 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhoP15409 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhoP15409 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhoP15409 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhoP15409 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhoP15409 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhoP15409 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhoP15409 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhoP15409 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhoP15409 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhoP15409 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhoP15409 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhoP15409 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhoP15409 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhoP15409 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhoP15409 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhoP15409 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhoP15409 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhoP15409 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhoP15409 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhoP15409 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhoP15409 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhoP15409 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhoP15409 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhoP15409 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhoP15409 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhoP15409 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhoP15409 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhoP15409 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RhoP15409 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RhoP15409 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RhoP15409 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RhoP15409 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhoP15409 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhoP15409 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhoP15409 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhoP15409 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhoP15409 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RhoP15409 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhoP15409 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhoP15409 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhoP15409 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RhoP15409 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhoP15409 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhoP15409 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhoP15409 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhoP15409 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhoP15409 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhoP15409 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhoP15409 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhoP15409 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RhoP15409 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhoP15409 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhoP15409 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhoP15409 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhoP15409 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhoP15409 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhoP15409 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhoP15409 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhoP15409 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhoP15409 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhoP15409 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhoP15409 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhoP15409 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhoP15409 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhoP15409 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhoP15409 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhoP15409 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhoP15409 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhoP15409 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhoP15409 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhoP15409 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhoP15409 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhoP15409 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhoP15409 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhoP15409 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhoP15409 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhoP15409 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhoP15409 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhoP15409 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhoP15409 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhoP15409 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhoP15409 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhoP15409 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhoP15409 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhoP15409 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhoP15409 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhoP15409 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhoP15409 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhoP15409 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhoP15409 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhoP15409 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RhoP15409 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhoP15409 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhoP15409 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.8 ms