Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prf1P10820 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Prf1P10820 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prf1P10820 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prf1P10820 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prf1P10820 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prf1P10820 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prf1P10820 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prf1P10820 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prf1P10820 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prf1P10820 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms