Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb3P09026 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb3P09026 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms