Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mfsd4b4J3QNS5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4b4J3QNS5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms