Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms