Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trpv2Q9WTR1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trpv2Q9WTR1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpv2Q9WTR1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms