Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SETD1BQ9UPS6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms