Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col5a3Q9JLI2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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