Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bgrlQ9JJU8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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