Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM43Q96BQ3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms