Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dkk4Q8VEJ3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk4Q8VEJ3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms