Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec22cQ8BXT9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec22cQ8BXT9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec22cQ8BXT9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec22cQ8BXT9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec22cQ8BXT9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sec22cQ8BXT9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec22cQ8BXT9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms