Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc30Q8BVF4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc30Q8BVF4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc30Q8BVF4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms