Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med16Q6PGF3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med16Q6PGF3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms