Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC62Q6P9F0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC62Q6P9F0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms