Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
NipblQ6KCD5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NipblQ6KCD5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms