Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uspl1Q3ULM6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms