Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ulk3Q3U3Q1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ulk3Q3U3Q1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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