Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc10Q3TLI0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1082.8 ms