Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 YOR331CYOR331C 558 nt3.14□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 DAL5YJR152W 1632 nt3.14□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 SMC2YFR031C 3513 nt3.14□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 ATG26YLR189C 3597 nt3.13□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 YMR317WYMR317W 3423 nt3.13□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 DNM1YLL001W 2274 nt3.13□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 AVT2YEL064C 1443 nt3.13□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 MRM2YGL136C 963 nt3.13□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 VMA10YHR039C-A 345 nt3.13□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 YIR040CYIR040C 333 nt3.13□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 DAD2YKR083C 402 nt3.13□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 VPS63YLR261C 327 nt3.13□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 TIF11YMR260C 462 nt3.13□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 YOL159CYOL159C 516 nt3.13□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 SVS1YPL163C 783 nt3.13□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 PES4YFR023W 1836 nt3.13□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 GYL1YMR192W 2163 nt3.12□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 BMS1YPL217C 3552 nt3.12□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 YPS6YIR039C 1614 nt3.12□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 YCG1YDR325W 3108 nt3.12□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 snR59snR59 78 nt3.12□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 CPR5YDR304C 678 nt3.12□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 YFL065CYFL065C 309 nt3.12□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 YGR073CYGR073C 372 nt3.12□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 ECL1YGR146C 636 nt3.12□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 PCL5YHR071W 690 nt3.12□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 RPS28BYLR264W 204 nt3.12□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 YLR297WYLR297W 390 nt3.12□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 YML084WYML084W 309 nt3.12□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 SSN8YNL025C 972 nt3.12□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 PFY1YOR122C 381 nt3.12□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 YPR050CYPR050C 414 nt3.12□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 BEM4YPL161C 1902 nt3.12□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 ENA5YDR038C 3276 nt3.12□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 ENA2YDR039C 3276 nt3.12□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 ENA1YDR040C 3276 nt3.12□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 ARO1YDR127W 4767 nt3.12□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 MPS1YDL028C 2295 nt3.12□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.11□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 PET54YGR222W 882 nt3.11□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 YAP3YHL009C 993 nt3.11□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt3.11□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 TDA8YAL064C-A 381 nt3.11□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 YLR224WYLR224W 1110 nt3.11□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 NGL1YOL042W 1092 nt3.11□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 SRL1YOR247W 633 nt3.11□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 YOR248WYOR248W 303 nt3.11□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 snR35snR35 204 nt3.11□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 AIM4YBR194W 372 nt3.11□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 DPB3YBR278W 606 nt3.11□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 APC5YOR249C 2058 nt3.11□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 MET10YFR030W 3108 nt3.11□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 CDH1YGL003C 1701 nt3.1□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 GLC3YEL011W 2115 nt3.1□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 SPP382YLR424W 2127 nt3.1□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 PRP22YER013W 3438 nt3.1□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 MNT3YIL014W 1893 nt3.1□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 YHR125WYHR125W 306 nt3.1□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 AFB1YLR040C 675 nt3.1□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 SEC22YLR268W 645 nt3.1□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 ERG2YMR202W 669 nt3.1□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.1□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 INO4YOL108C 456 nt3.1□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt3.1□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 SLK19YOR195W 2466 nt3.1□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 YKR078WYKR078W 1758 nt3.1□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 BCH1YMR237W 2175 nt3.1□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 TGL3YMR313C 1929 nt3.09□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 SHE4YOR035C 2370 nt3.09□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 EPL1YFL024C 2499 nt3.09□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 snR68snR68 136 nt3.09□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 SMX2YFL017W-A 234 nt3.09□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 CDC26YFR036W 375 nt3.09□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 COX23YHR116W 456 nt3.09□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 YLR101CYLR101C 396 nt3.09□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 RPS16AYMR143W 432 nt3.09□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 YNL089CYNL089C 477 nt3.09□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 ATX1YNL259C 222 nt3.09□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 YBR051WYBR051W 351 nt3.09□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 snR42snR42 351 nt3.09□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 GPX2YBR244W 489 nt3.09□□□□□ -1.91
UBX3Q12229 TOM70YNL121C 1854 nt3.09□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 STE6YKL209C 3873 nt3.09□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 FKH2YNL068C 2589 nt3.08□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 SRD1YCR018C 666 nt3.08□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.08□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YIL141WYIL141W 390 nt3.08□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 RPL6BYLR448W 531 nt3.08□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 CMC2YBL059C-A 330 nt3.08□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YPR096CYPR096C 303 nt3.08□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt3.08□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 SWC4YGR002C 1431 nt3.08□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.08□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.08□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.08□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 MDM36YPR083W 1740 nt3.07□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt3.07□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 YCR064CYCR064C 411 nt3.07□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 HNT1YDL125C 477 nt3.07□□□□□ -1.92
UBX3Q12229 SWF1YDR126W 1011 nt3.07□□□□□ -1.92
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