Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bop1P97452 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bop1P97452 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bop1P97452 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bop1P97452 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bop1P97452 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bop1P97452 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bop1P97452 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bop1P97452 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bop1P97452 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bop1P97452 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bop1P97452 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bop1P97452 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bop1P97452 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bop1P97452 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bop1P97452 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms