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Protein–RNA interactions for Protein: P53047
RTA1, Protein RTA1, yeast
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317 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
RTA1
P53047
MCR1
YKL150W
909 nt
3.78
□□□□□ -1.8
RTA1
P53047
OST6
YML019W
999 nt
3.78
□□□□□ -1.8
RTA1
P53047
TIF11
YMR260C
462 nt
3.78
□□□□□ -1.8
RTA1
P53047
HHF2
YNL030W
312 nt
3.78
□□□□□ -1.8
RTA1
P53047
RDS1
YCR106W
2499 nt
3.78
□□□□□ -1.8
RTA1
P53047
VBA4
YDR119W
2307 nt
3.77
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
NUG1
YER006W
1563 nt
3.77
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
CDC45
YLR103C
1953 nt
3.77
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
ATP5
YDR298C
639 nt
3.77
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
YGL074C
YGL074C
327 nt
3.77
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
PXR1
YGR280C
816 nt
3.77
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
RMP1
YLR145W
606 nt
3.77
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
YOL159C
YOL159C
516 nt
3.77
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
RPS23B
YPR132W
438 nt
3.77
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
VAC8
YEL013W
1737 nt
3.77
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
ALY1
YKR021W
2748 nt
3.77
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
GDI1
YER136W
1356 nt
3.76
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
IOC2
YLR095C
2439 nt
3.76
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
SKN7
YHR206W
1869 nt
3.76
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
MNT3
YIL014W
1893 nt
3.76
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
YCR081C-A
YCR081C-A
237 nt
3.76
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
YCR090C
YCR090C
549 nt
3.76
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
MGT1
YDL200C
567 nt
3.76
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
YER135C
YER135C
393 nt
3.76
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
SDP1
YIL113W
630 nt
3.76
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
PKR1
YMR123W
369 nt
3.76
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
RSM19
YNR037C
276 nt
3.76
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
NGL1
YOL042W
1092 nt
3.76
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
TRK1
YJL129C
3708 nt
3.76
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
SIZ1
YDR409W
2715 nt
3.76
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
RAD4
YER162C
2265 nt
3.75
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
AIP1
YMR092C
1848 nt
3.75
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
DAS1
YJL149W
1992 nt
3.75
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
SMB1
YER029C
591 nt
3.75
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
YER091C-A
YER091C-A
222 nt
3.75
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
MRPL38
YKL170W
417 nt
3.75
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
HSP10
YOR020C
321 nt
3.75
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
PWP2
YCR057C
2772 nt
3.75
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
ARK1
YNL020C
1917 nt
3.75
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
NMA111
YNL123W
2994 nt
3.75
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
YLR001C
YLR001C
2589 nt
3.74
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
ETP1
YHL010C
1758 nt
3.74
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
SRC1
YML034W
2505 nt
3.74
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
AHC2
YCR082W
387 nt
3.74
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
YER079W
YER079W
633 nt
3.74
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
LSM8
YJR022W
330 nt
3.74
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
IRC19
YLL033W
693 nt
3.74
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
YNL058C
YNL058C
951 nt
3.74
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
YPR077C
YPR077C
372 nt
3.74
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
YMR018W
YMR018W
1545 nt
3.74
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
MYO5
YMR109W
3660 nt
3.74
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
FAA2
YER015W
2235 nt
3.74
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
RAD26
YJR035W
3258 nt
3.73
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
YGL140C
YGL140C
3660 nt
3.73
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
IES6
YEL044W
501 nt
3.73
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
YER087C-A
YER087C-A
552 nt
3.73
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
YGL042C
YGL042C
306 nt
3.73
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
RPB9
YGL070C
369 nt
3.73
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
YHR138C
YHR138C
345 nt
3.73
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
MRPL20
YKR085C
588 nt
3.73
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
YOR053W
YOR053W
342 nt
3.73
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
YBR012C
YBR012C
420 nt
3.73
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
PFY1
YOR122C
381 nt
3.73
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
YOR293C-A
YOR293C-A
150 nt
3.73
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
IRC16
YPR038W
360 nt
3.73
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
UTP13
YLR222C
2454 nt
3.73
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
MRPL11
YDL202W
750 nt
3.72
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
COX19
YLL018C-A
297 nt
3.72
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
TVP18
YMR071C
504 nt
3.72
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
YNL179C
YNL179C
438 nt
3.72
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
RPL23A
YBL087C
414 nt
3.72
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
COP1
YDL145C
3606 nt
3.72
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
DIT2
YDR402C
1470 nt
3.72
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
BYE1
YKL005C
1785 nt
3.71
□□□□□ -1.81
RTA1
P53047
BNI4
YNL233W
2679 nt
3.71
□□□□□ -1.82
RTA1
P53047
CWC22
YGR278W
1734 nt
3.71
□□□□□ -1.82
RTA1
P53047
NBL1
YHR199C-A
222 nt
3.71
□□□□□ -1.82
RTA1
P53047
YAL068W-A
YAL068W-A
255 nt
3.71
□□□□□ -1.82
RTA1
P53047
YPL080C
YPL080C
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3.71
□□□□□ -1.82
RTA1
P53047
VPS3
YDR495C
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3.71
□□□□□ -1.82
RTA1
P53047
ELM1
YKL048C
1923 nt
3.71
□□□□□ -1.82
RTA1
P53047
URA2
YJL130C
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RTA1
P53047
SLA1
YBL007C
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□□□□□ -1.82
RTA1
P53047
DAN4
YJR151C
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3.71
□□□□□ -1.82
RTA1
P53047
TRS120
YDR407C
3870 nt
3.7
□□□□□ -1.82
RTA1
P53047
ZDS2
YML109W
2829 nt
3.7
□□□□□ -1.82
RTA1
P53047
PDX1
YGR193C
1233 nt
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□□□□□ -1.82
RTA1
P53047
TPM2
YIL138C
486 nt
3.7
□□□□□ -1.82
RTA1
P53047
YML084W
YML084W
309 nt
3.7
□□□□□ -1.82
RTA1
P53047
CMC2
YBL059C-A
330 nt
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□□□□□ -1.82
RTA1
P53047
HHT2
YNL031C
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□□□□□ -1.82
RTA1
P53047
YOL150C
YOL150C
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□□□□□ -1.82
RTA1
P53047
YPL034W
YPL034W
498 nt
3.7
□□□□□ -1.82
RTA1
P53047
AVT2
YEL064C
1443 nt
3.7
□□□□□ -1.82
RTA1
P53047
SPE1
YKL184W
1401 nt
3.7
□□□□□ -1.82
RTA1
P53047
RAD5
YLR032W
3510 nt
3.69
□□□□□ -1.82
RTA1
P53047
NOP4
YPL043W
2058 nt
3.69
□□□□□ -1.82
RTA1
P53047
YPR022C
YPR022C
3402 nt
3.69
□□□□□ -1.82
RTA1
P53047
YER038W-A
YER038W-A
381 nt
3.69
□□□□□ -1.82
RTA1
P53047
LIF1
YGL090W
1266 nt
3.69
□□□□□ -1.82
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