Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 CBS2YDR197W 1170 nt2.7□□□□□ -1.98
SEC28P40509 RMD6YEL072W 696 nt2.7□□□□□ -1.98
SEC28P40509 PCL5YHR071W 690 nt2.7□□□□□ -1.98
SEC28P40509 NYV1YLR093C 762 nt2.7□□□□□ -1.98
SEC28P40509 MST28YAR033W 705 nt2.7□□□□□ -1.98
SEC28P40509 RPS1AYLR441C 768 nt2.7□□□□□ -1.98
SEC28P40509 IRC21YMR073C 606 nt2.7□□□□□ -1.98
SEC28P40509 DNL4YOR005C 2835 nt2.7□□□□□ -1.98
SEC28P40509 TOP2YNL088W 4287 nt2.7□□□□□ -1.98
SEC28P40509 YPL150WYPL150W 2706 nt2.7□□□□□ -1.98
SEC28P40509 NSE4YDL105W 1209 nt2.69□□□□□ -1.98
SEC28P40509 BMT5YIL096C 1011 nt2.69□□□□□ -1.98
SEC28P40509 YAL066WYAL066W 309 nt2.69□□□□□ -1.98
SEC28P40509 JIP3YLR331C 378 nt2.69□□□□□ -1.98
SEC28P40509 SGT1YOR057W 1188 nt2.69□□□□□ -1.98
SEC28P40509 ISU1YPL135W 498 nt2.69□□□□□ -1.98
SEC28P40509 SSP1YHR184W 1716 nt2.68□□□□□ -1.98
SEC28P40509 RLF2YPR018W 1821 nt2.68□□□□□ -1.98
SEC28P40509 NAB3YPL190C 2409 nt2.68□□□□□ -1.98
SEC28P40509 snR78snR78 87 nt2.68□□□□□ -1.98
SEC28P40509 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.68□□□□□ -1.98
SEC28P40509 MIC19YFR011C 513 nt2.68□□□□□ -1.98
SEC28P40509 SMD2YLR275W 333 nt2.68□□□□□ -1.98
SEC28P40509 ECI1YLR284C 843 nt2.68□□□□□ -1.98
SEC28P40509 MPP6YNR024W 561 nt2.68□□□□□ -1.98
SEC28P40509 MSN1YOL116W 1149 nt2.68□□□□□ -1.98
SEC28P40509 SPR2YOR214C 711 nt2.68□□□□□ -1.98
SEC28P40509 SFG1YOR315W 1041 nt2.68□□□□□ -1.98
SEC28P40509 ACM1YPL267W 630 nt2.68□□□□□ -1.98
SEC28P40509 RXT2YBR095C 1293 nt2.68□□□□□ -1.98
SEC28P40509 ESL1YIL151C 3357 nt2.68□□□□□ -1.98
SEC28P40509 LST4YKL176C 2487 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC28P40509 SDC25YLL016W 3147 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC28P40509 YCR100CYCR100C 951 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC28P40509 OTU2YHL013C 924 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC28P40509 SUI2YJR007W 915 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC28P40509 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC28P40509 CAT5YOR125C 702 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC28P40509 RPS12YOR369C 432 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC28P40509 LCL1YPL056C 306 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC28P40509 CIN2YPL241C 807 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC28P40509 CUR1YPR158W 759 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC28P40509 YIL080WYIL080W 4722 nt2.67□□□□□ -1.98
SEC28P40509 RAD18YCR066W 1464 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC28P40509 COG3YER157W 2406 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC28P40509 snR76snR76 109 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC28P40509 HYP2YEL034W 474 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC28P40509 STE2YFL026W 1296 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC28P40509 THG1YGR024C 714 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC28P40509 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC28P40509 MBB1YJL199C 327 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC28P40509 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC28P40509 YAP7YOL028C 738 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC28P40509 CRS5YOR031W 210 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC28P40509 PUF4YGL014W 2667 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC28P40509 YJL132WYJL132W 2253 nt2.66□□□□□ -1.98
SEC28P40509 MMS1YPR164W 4224 nt2.65□□□□□ -1.98
SEC28P40509 YKU80YMR106C 1890 nt2.65□□□□□ -1.98
SEC28P40509 SEC7YDR170C 6030 nt2.65□□□□□ -1.98
SEC28P40509 ATP16YDL004W 483 nt2.65□□□□□ -1.99
SEC28P40509 YIP5YGL161C 933 nt2.65□□□□□ -1.99
SEC28P40509 YGL218WYGL218W 651 nt2.65□□□□□ -1.99
SEC28P40509 EST3YIL009C-A 546 nt2.65□□□□□ -1.99
SEC28P40509 YPT52YKR014C 705 nt2.65□□□□□ -1.99
SEC28P40509 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt2.65□□□□□ -1.99
SEC28P40509 RPS29AYLR388W 171 nt2.65□□□□□ -1.99
SEC28P40509 PAI3YMR174C 207 nt2.65□□□□□ -1.99
SEC28P40509 ESF2YNR054C 951 nt2.65□□□□□ -1.99
SEC28P40509 BFR1YOR198C 1413 nt2.65□□□□□ -1.99
SEC28P40509 FAR11YNL127W 2862 nt2.65□□□□□ -1.99
SEC28P40509 AMS1YGL156W 3252 nt2.65□□□□□ -1.99
SEC28P40509 SGM1YJR134C 2124 nt2.65□□□□□ -1.99
SEC28P40509 ALY1YKR021W 2748 nt2.64□□□□□ -1.99
SEC28P40509 SMY2YBR172C 2223 nt2.64□□□□□ -1.99
SEC28P40509 GPI19YDR437W 423 nt2.64□□□□□ -1.99
SEC28P40509 RTS3YGR161C 792 nt2.64□□□□□ -1.99
SEC28P40509 COA4YLR218C 453 nt2.64□□□□□ -1.99
SEC28P40509 SRO77YBL106C 3033 nt2.64□□□□□ -1.99
SEC28P40509 NEL1YHR035W 1893 nt2.64□□□□□ -1.99
SEC28P40509 VPS64YDR200C 1815 nt2.63□□□□□ -1.99
SEC28P40509 TMA64YDR117C 1698 nt2.63□□□□□ -1.99
SEC28P40509 PCK1YKR097W 1650 nt2.63□□□□□ -1.99
SEC28P40509 SIP3YNL257C 3690 nt2.63□□□□□ -1.99
SEC28P40509 YCR090CYCR090C 549 nt2.63□□□□□ -1.99
SEC28P40509 YJR020WYJR020W 333 nt2.63□□□□□ -1.99
SEC28P40509 YBR062CYBR062C 543 nt2.63□□□□□ -1.99
SEC28P40509 PIS1YPR113W 663 nt2.63□□□□□ -1.99
SEC28P40509 CBP6YBR120C 489 nt2.63□□□□□ -1.99
SEC28P40509 DNA2YHR164C 4569 nt2.63□□□□□ -1.99
SEC28P40509 TPS2YDR074W 2691 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC28P40509 PSD2YGR170W 3417 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC28P40509 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC28P40509 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC28P40509 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC28P40509 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC28P40509 YER189WYER189W 369 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC28P40509 CWC23YGL128C 852 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC28P40509 YGR053CYGR053C 852 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC28P40509 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC28P40509 RGM1YMR182C 636 nt2.62□□□□□ -1.99
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