Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxa10P31310 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa10P31310 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms