Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RXRAP19793 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RXRAP19793 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RXRAP19793 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RXRAP19793 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RXRAP19793 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RXRAP19793 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RXRAP19793 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RXRAP19793 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RXRAP19793 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RXRAP19793 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RXRAP19793 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RXRAP19793 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RXRAP19793 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RXRAP19793 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RXRAP19793 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RXRAP19793 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RXRAP19793 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RXRAP19793 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RXRAP19793 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RXRAP19793 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RXRAP19793 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RXRAP19793 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RXRAP19793 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RXRAP19793 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RXRAP19793 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RXRAP19793 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RXRAP19793 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RXRAP19793 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RXRAP19793 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RXRAP19793 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RXRAP19793 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RXRAP19793 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RXRAP19793 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RXRAP19793 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RXRAP19793 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RXRAP19793 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RXRAP19793 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RXRAP19793 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RXRAP19793 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RXRAP19793 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RXRAP19793 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RXRAP19793 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RXRAP19793 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RXRAP19793 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RXRAP19793 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RXRAP19793 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RXRAP19793 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RXRAP19793 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RXRAP19793 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RXRAP19793 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RXRAP19793 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RXRAP19793 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RXRAP19793 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RXRAP19793 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RXRAP19793 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RXRAP19793 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RXRAP19793 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RXRAP19793 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RXRAP19793 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RXRAP19793 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RXRAP19793 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RXRAP19793 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RXRAP19793 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RXRAP19793 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RXRAP19793 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RXRAP19793 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RXRAP19793 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RXRAP19793 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RXRAP19793 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RXRAP19793 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RXRAP19793 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RXRAP19793 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RXRAP19793 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RXRAP19793 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RXRAP19793 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RXRAP19793 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RXRAP19793 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RXRAP19793 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RXRAP19793 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RXRAP19793 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RXRAP19793 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RXRAP19793 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRAP19793 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRAP19793 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRAP19793 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRAP19793 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRAP19793 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRAP19793 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRAP19793 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRAP19793 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRAP19793 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRAP19793 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRAP19793 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRAP19793 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRAP19793 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRAP19793 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRAP19793 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRAP19793 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRAP19793 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms