Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhoP15409 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RhoP15409 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RhoP15409 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RhoP15409 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RhoP15409 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RhoP15409 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RhoP15409 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RhoP15409 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RhoP15409 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RhoP15409 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RhoP15409 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RhoP15409 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RhoP15409 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RhoP15409 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RhoP15409 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RhoP15409 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RhoP15409 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RhoP15409 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RhoP15409 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RhoP15409 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RhoP15409 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RhoP15409 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RhoP15409 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RhoP15409 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RhoP15409 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RhoP15409 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RhoP15409 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RhoP15409 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RhoP15409 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RhoP15409 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RhoP15409 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RhoP15409 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RhoP15409 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RhoP15409 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RhoP15409 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RhoP15409 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RhoP15409 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhoP15409 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhoP15409 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhoP15409 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhoP15409 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhoP15409 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhoP15409 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhoP15409 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhoP15409 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhoP15409 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RhoP15409 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhoP15409 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhoP15409 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhoP15409 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhoP15409 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RhoP15409 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RhoP15409 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RhoP15409 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RhoP15409 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RhoP15409 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RhoP15409 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RhoP15409 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RhoP15409 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RhoP15409 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RhoP15409 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RhoP15409 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RhoP15409 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RhoP15409 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhoP15409 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhoP15409 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhoP15409 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhoP15409 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhoP15409 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhoP15409 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhoP15409 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhoP15409 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhoP15409 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhoP15409 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RhoP15409 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhoP15409 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RhoP15409 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhoP15409 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RhoP15409 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RhoP15409 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RhoP15409 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RhoP15409 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RhoP15409 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RhoP15409 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RhoP15409 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RhoP15409 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RhoP15409 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhoP15409 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhoP15409 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhoP15409 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RhoP15409 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhoP15409 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhoP15409 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhoP15409 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhoP15409 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhoP15409 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhoP15409 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhoP15409 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhoP15409 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms