Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prf1P10820 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prf1P10820 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prf1P10820 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prf1P10820 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prf1P10820 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prf1P10820 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prf1P10820 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prf1P10820 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prf1P10820 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms