Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vamp4O70480 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vamp4O70480 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms