Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trappc8E9PWG2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Trappc8E9PWG2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms