Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brpf1B2RRD7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brpf1B2RRD7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms