Protein–RNA interactions for Protein: A6NN06

Putative UPF0633 protein MGC21881, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NN06 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A6NN06 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A6NN06 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
A6NN06 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1138.7 ms