Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc27A2A6Q5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms