Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubl3Q9Z2M6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubl3Q9Z2M6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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