Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SETD1BQ9UPS6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SETD1BQ9UPS6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SETD1BQ9UPS6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms