Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod3Q9R0E1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod3Q9R0E1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms