Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PnckQ9QYK9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PnckQ9QYK9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PnckQ9QYK9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PnckQ9QYK9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PnckQ9QYK9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PnckQ9QYK9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PnckQ9QYK9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PnckQ9QYK9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PnckQ9QYK9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PnckQ9QYK9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms