Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Col5a3Q9JLI2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col5a3Q9JLI2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms