Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3glb1Q9JK48 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3glb1Q9JK48 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.3 ms