Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C1

ZMYND12, Zinc finger MYND domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND12Q9H0C1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMYND12Q9H0C1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
ZMYND12Q9H0C1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZMYND12Q9H0C1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZMYND12Q9H0C1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZMYND12Q9H0C1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZMYND12Q9H0C1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZMYND12Q9H0C1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZMYND12Q9H0C1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZMYND12Q9H0C1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZMYND12Q9H0C1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZMYND12Q9H0C1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZMYND12Q9H0C1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZMYND12Q9H0C1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZMYND12Q9H0C1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZMYND12Q9H0C1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZMYND12Q9H0C1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZMYND12Q9H0C1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ZMYND12Q9H0C1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZMYND12Q9H0C1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZMYND12Q9H0C1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZMYND12Q9H0C1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms