Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Necab3Q9D6J4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Necab3Q9D6J4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Necab3Q9D6J4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Necab3Q9D6J4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Necab3Q9D6J4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Necab3Q9D6J4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Necab3Q9D6J4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Necab3Q9D6J4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Necab3Q9D6J4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Necab3Q9D6J4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Necab3Q9D6J4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Necab3Q9D6J4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms