Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim3Q99PE5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.2 ms