Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM43Q96BQ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM43Q96BQ3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms