Protein–RNA interactions for Protein: Q8VGL0

Olfr340, Olfactory receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Olfr340Q8VGL0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Olfr340Q8VGL0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Olfr340Q8VGL0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Olfr340Q8VGL0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Olfr340Q8VGL0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Olfr340Q8VGL0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Olfr340Q8VGL0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Olfr340Q8VGL0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Olfr340Q8VGL0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Olfr340Q8VGL0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Olfr340Q8VGL0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Olfr340Q8VGL0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Olfr340Q8VGL0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Olfr340Q8VGL0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Olfr340Q8VGL0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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Olfr340Q8VGL0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Olfr340Q8VGL0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Olfr340Q8VGL0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Olfr340Q8VGL0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Olfr340Q8VGL0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Olfr340Q8VGL0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Olfr340Q8VGL0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Olfr340Q8VGL0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Olfr340Q8VGL0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Olfr340Q8VGL0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Olfr340Q8VGL0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Olfr340Q8VGL0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Olfr340Q8VGL0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Olfr340Q8VGL0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Olfr340Q8VGL0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Olfr340Q8VGL0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Olfr340Q8VGL0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Olfr340Q8VGL0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Olfr340Q8VGL0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Olfr340Q8VGL0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Olfr340Q8VGL0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Olfr340Q8VGL0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Olfr340Q8VGL0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Olfr340Q8VGL0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Olfr340Q8VGL0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Olfr340Q8VGL0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Olfr340Q8VGL0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Olfr340Q8VGL0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Olfr340Q8VGL0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Olfr340Q8VGL0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Olfr340Q8VGL0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Olfr340Q8VGL0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Olfr340Q8VGL0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Olfr340Q8VGL0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Olfr340Q8VGL0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Olfr340Q8VGL0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Olfr340Q8VGL0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Olfr340Q8VGL0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Olfr340Q8VGL0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Olfr340Q8VGL0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Olfr340Q8VGL0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Olfr340Q8VGL0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Olfr340Q8VGL0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Olfr340Q8VGL0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Olfr340Q8VGL0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Olfr340Q8VGL0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Olfr340Q8VGL0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Olfr340Q8VGL0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Olfr340Q8VGL0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms