Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Card11Q8CIS0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Card11Q8CIS0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Card11Q8CIS0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms