Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP30Q70CQ3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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USP30Q70CQ3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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USP30Q70CQ3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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USP30Q70CQ3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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USP30Q70CQ3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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USP30Q70CQ3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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USP30Q70CQ3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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USP30Q70CQ3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP30Q70CQ3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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